VerbaAlpina besteht aus folgenden Modulen:

- VA_DB: Datenbestand in der (MySQL-)Projekt-Datenbank (va_xxx)
- VA_WEB: Programmcode der Webschnittstelle des Projektportals www.verba-alpina.gwi.uni-muenchen.de samt zugehöriger Wordpress-Datenbank (va_wp)
- VA_MT: Mediendateien (Photos, Filme, Text- und Tondokumente), die sich in der Medienbibliothek der Webschnittstelle befinden
Alle drei Module bilden ein konsistentes Ganzes mit wechselseitigen Verknüpfungen und Abhängigkeiten und können daher nicht voneinander getrennt werden. Während der Projektlaufzeit wird halbjährlich, jeweils Mitte des Jahres und gegen Ende des Jahres, simultan der jeweils aktuelle Status der Module VA_DB und VA_WEB in Gestalt einer elektronischen Kopie gleichsam "eingefroren". Diese eingefrorenen Kopien erhalten Versionsnummern nach dem Schema [Kalenderjahr]/[laufende Nummer] (z .B. 15/1). Die jeweils produktive VA-Version erhält die Bezeichnung XXX (vgl. Zitierweise).
Die Erzeugung von Kopien der VA-Mediathek (VA_MT) verbietet sich aufgrund der üblicherweise enormen Größe von Mediendateien. Aus diesem Grund wird von diesem Modul im Zuge eines Versionierungsvorgangs keine Kopie erzeugt. Einmal dort abgelegte Elemente können daher, sofern auch nur eine einzige VA-Version mit ihnen verknüpft ist, nicht aus der VA-Mediathek entfernt werden.
Im Projektportal besteht die Möglichkeit, zwischen der jeweils "produktiven" und daher ständigen Änderungen unterworfenen VA-Version sowie den archivierten, "eingefrorenen" Versionen zu wechseln. Im Projektportal wird durch geeignete Farbgebung des Hintergrunds bzw. bestimmter Bedienelemente angezeigt, ob man sich in der produktiven oder einer archivierten Version von VA befindet. Zitierfähig sind *ausschließlich* die archivierten Versionen von VA.
Beim Wechsel in eine ältere Version von VerbaAlpina wird lediglich der präsentierte Datenbestand, also VA_DB, geändert. Der gleichzeitige Wechsel in die entsprechende Version von VA_WEB, der mit der Änderung von Funktionalitäten und Design einhergehen würde, ist aufgrund technischer Sicherheitsrisiken und wegen der technologischen Abhängigkeiten von Serversoftware und Softwareframeworks nicht möglich. Stattdessen werden die Daten einer älteren VA_DB-Version stets im Gewand der jeweils aktuellen Version von VA_WEB präsentiert.
Eine kompakte Übersicht über die jeweiligen Neuerungen in den einzelnen VerbaAlpina-Versionen gegenüber der jeweiligen Vorgängerversion findet sich in der sog. "Timeline".